موسس عبارت است از مدیر حوزه های علمیه

وظايف و اختيارات هیئت امنا:

1. تصویب اسناد راهبردی، سیاست ها، خط مشی­ها و برنامه­های کلان پژوهشکده؛
2. تصویب آئین نامه‌ها و دستورالعمل‌های اجرائی؛
3. تصویب برنامه و بودجه سالیانه؛
4. نظارت کلان بر حسن اجرای فعالیت‌ها؛
5. بررسی گزارش عملکرد سالانه و موردی؛
6. تصویب ساختار، پست­های تشکیلاتی و افزایش و یا کاهش گروه های علمی؛

رییس پژوهشکده، مسئول اجرایی آن است که از میان اعضای هیئت امنا یا دیگر فضلا و شخصیت‌های علمی حوزه، به پیشنهاد رییس و تایید اعضای هیئت امنا انتخاب می شود.